تتمركز القصة على سمكة تهرب من بيتها في البحر، وتنتهي بالمحاصرة على الشاطئ، وينقذها طفل في عمر الخامسة يُدعى (سوسكي)، يُعجب بالسمكة الذهبية ويطلق عليها اسم (بونيو)، ويتعهد بحمايتها إلى الأبد. وفي هذه الأثناء قام والدها (فوجيموتو) بالبحث عنها في كل مكان. فكيف أرجعها والدها للبيت؟ وكيف هربت؟ وماذا كان مصيرها بالنهاية؟