عند لقائهم لأول مرة، أصبح مقاتل الشوارع غير المهزوم دايمون وماسارو والمنشق ديجيمون أغومون أصدقاء بالطريقة الأكثر طبيعية الممكنة للثنائي الأحمق - من خلال القتال بكل قوة. يتم تجنيد «الفريق النهائي» المُعلن ذاتيًا من قبل منظمة حكومية سرية تسمى Digimon Data Squad، أو DATS، والتي شهدت ضربة قتالية بشرية لا تصدق بضربة باستخدام Digimon. هدفهم الأساسي هو التحقيق في المشاكل الغامضة التي سببها دخول Digimon إلى العالم الحقيقي، والعالم حاليًا في خضم أزمة مع ظهور Digimon بمعدل غير مسبوق. عند الشروع في مهمات مختلفة مع DATS، أصبح دايمون وأغومون زملاء مع العبقري المراهق توما نورستين وشريكه في الديجيمون غاومان، جنبًا إلى جنب مع يوشينو «يوشي» فوجيدا طيب القلب وشريكتها في الديجيمون لالامون. مع استمرار المجموعة في التحقيق في الزيادة السريعة لـ Digimon في عالمهم، تبدأ حقيقة أكثر ظلمة في الظهور، والأمر متروك لـ Daimon و Agumon وأصدقائهم للوصول إلى حقيقة الأمور.