تقف مدينة الأكاديمية في طليعة التقدم العلمي والتكنولوجي، وتشتهر بتطوير الإسبرز: أولئك القادرين على استخدام القدرات الخارقة التي تغير قواعد الواقع. الأقوى من بينها هو المستوى 5s، والمستوى المعروف باسم Accelerator هو السائد، حتى بعد إضعافه بسبب إصابة خطيرة في الدماغ. إلى جانبه توجد الفتاة الصغيرة المعروفة باسم Last Order، والتي على الرغم من سلوكه البارد، يتمسك بها عن كثب ويتعهد بحمايتها بأي ثمن. على الرغم من أن Accelerator قد يتعافى من إصابته، إلا أن الجانب المظلم من Academy City لا يهدأ أبدًا، ولذلك يجد نفسه عالقًا على غير قصد في خضم صراع جديد. عندما تقترب شابة غامضة من Accelerator سعياً وراء تحقيق Last Order، يواجه صاحب أعلى تصنيف منظمة سامة ترسخت جذورها في منظمة Anti-Skill، وهي منظمة لحفظ السلام في Academy City. مع تحرك قوى خطيرة تهدد بتعريض Last Order وأخواتها للخطر، تستعد الشريرة التي نصبت نفسها للدخول إلى الظلام مرة أخرى.